23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0575 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0575  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2774  hypothetical protein  58.05 
 
 
254 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4622  hypothetical protein  56.33 
 
 
230 aa  271  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0644  hypothetical protein  31.9 
 
 
284 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538216  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3009  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  27.32 
 
 
238 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  27.38 
 
 
185 aa  48.9  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  26.67 
 
 
188 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  29.63 
 
 
202 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.79 
 
 
276 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  23.67 
 
 
287 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  25.2 
 
 
283 aa  45.4  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  25.2 
 
 
283 aa  45.4  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  23.65 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  28.85 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  25 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  25 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  23.48 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  35.06 
 
 
174 aa  42.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.12 
 
 
300 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  20.87 
 
 
276 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.35 
 
 
277 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  25.78 
 
 
267 aa  42  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  24.35 
 
 
277 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>