69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3009 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3009  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  100 
 
 		 238 aa  483  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4622  hypothetical protein  31.36 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2774  hypothetical protein  32.19 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0575  hypothetical protein  27.32 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0644  hypothetical protein  29.82 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538216  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.82 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  31.93 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.93 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  28.69 
 
 		 307 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  29.66 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  30.43 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  26.67 
 
 		 308 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.62 
 
 		 303 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  31.25 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  32.52 
 
 		 288 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  31.25 
 
 		 285 aa  48.9  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0447  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.56 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.58 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  28.95 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.16 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  34.83 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.73 
 
 		 297 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.19 
 
 		 308 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0432  HemK family modification methylase  31.4 
 
 		 282 aa  45.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  35 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.46 
 
 		 302 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.2 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  29.51 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  23.42 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  41.79 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3018  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.16 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  29.17 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  32.97 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  25.25 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.07 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30.69 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  29.67 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.71 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  31.46 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.69 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  27.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.86 
 
 		 314 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  30.59 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02756  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.3 
 
 		 316 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0268586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  27.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.23 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  28.46 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  31.54 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  34.04 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  27.72 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  30.86 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1850  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.52 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.72 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  28.89 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2417  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.53 
 
 		 314 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.74 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  30.11 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1803  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.58 
 
 		 288 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0806  modification methylase, HemK family  25 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.405188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  27.73 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  27.72 
 
 		 283 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  27.72 
 
 		 283 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1244  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.68 
 
 		 302 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  27.72 
 
 		 283 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  22.42 
 
 		 279 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.32 
 
 		 317 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>