74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4551 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  51.9 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  61.32 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  53.78 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  44.97 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  48.91 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  52.34 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  57.55 
 
 		 481 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  57.14 
 
 		 469 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  54.37 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  58.49 
 
 		 164 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  48.78 
 
 		 379 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  51.22 
 
 		 386 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  44 
 
 		 100 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  42.86 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  44.33 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  45.65 
 
 		 466 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  41.84 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  38.64 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  45.92 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  43.62 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  46.32 
 
 		 96 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  46.51 
 
 		 592 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  46.67 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  50.98 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  50.98 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  50.98 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  44.79 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  43.52 
 
 		 461 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  45.83 
 
 		 96 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 100 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  44.21 
 
 		 96 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  40.18 
 
 		 456 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  51.85 
 
 		 87 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  40.19 
 
 		 456 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  41.24 
 
 		 98 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  36.05 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 96 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 89 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 96 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  43.59 
 
 		 89 aa  48.5  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 84 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 85 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  31.08 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 85 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  39.8 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  43.66 
 
 		 855 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  44 
 
 		 88 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  34.88 
 
 		 85 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 94 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  43.04 
 
 		 84 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 88 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  44.62 
 
 		 118 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  42 
 
 		 87 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  34.67 
 
 		 85 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  42.31 
 
 		 86 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  33.93 
 
 		 386 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  37.37 
 
 		 102 aa  42  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  40.66 
 
 		 88 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  43.4 
 
 		 89 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  39.33 
 
 		 89 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  39.33 
 
 		 89 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  45.1 
 
 		 1381 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  45.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  45.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  45.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  45.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  45.1 
 
 		 1541 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  45.1 
 
 		 89 aa  41.2  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>