More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2731 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  71.8 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  71.8 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  71.8 
 
 		 292 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  70.18 
 
 		 277 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  70.98 
 
 		 285 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  70.59 
 
 		 285 aa  348  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  71.71 
 
 		 277 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  29.92 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.8 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  26.32 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  33.88 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  33.48 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  33.63 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  35.52 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  29.73 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  35.45 
 
 		 320 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  34.98 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.02 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  26.13 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  35.63 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  32.13 
 
 		 343 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  38.03 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  29.92 
 
 		 333 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  35.23 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  27.8 
 
 		 363 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  27.2 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  29.52 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  31.84 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  33.93 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  31.6 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  32.34 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  27.45 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  31.75 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  26.37 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  29.28 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  25.93 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  32.59 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  25.93 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  34.55 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  33.03 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  25.15 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  34.18 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.13 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.78 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.36 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  24.87 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  26.55 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  23.05 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.41 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  29.28 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  26.67 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  22.17 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.48 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.57 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  32.67 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  32.67 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  32.67 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  22.06 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  26.54 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  21.74 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  30.86 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  30.86 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  34.18 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  26.97 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  22.93 
 
 		 319 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  31.67 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  35.25 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  27.17 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  27.8 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0444  esterase  30.33 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  28.96 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.87 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  33.67 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.87 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  31.87 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>