163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1362 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
341 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  88.86 
 
 
341 aa  624  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  58.72 
 
 
351 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  56.98 
 
 
353 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  54.44 
 
 
346 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  54.44 
 
 
346 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  54.44 
 
 
346 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  51.45 
 
 
352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  37.74 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  37.5 
 
 
320 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  37.22 
 
 
320 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  36.59 
 
 
320 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  37.22 
 
 
321 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  35.65 
 
 
318 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  37.42 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.87 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  34.16 
 
 
334 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  33.23 
 
 
349 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  35.24 
 
 
313 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
337 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  34.42 
 
 
339 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35 
 
 
337 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  35.37 
 
 
352 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  34.93 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  33.03 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  31.45 
 
 
335 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  34.78 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  35.76 
 
 
367 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  32.85 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  34.16 
 
 
356 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  32.72 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  34.38 
 
 
340 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  34.24 
 
 
340 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  30.38 
 
 
316 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  32.97 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.48 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  31.72 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 
343 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  34.83 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 
323 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  30.9 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  32.25 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.85 
 
 
311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
317 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 
326 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  34.55 
 
 
335 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 
321 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  34.35 
 
 
330 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  31.02 
 
 
311 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  35.68 
 
 
355 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.99 
 
 
343 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.68 
 
 
355 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 
323 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 
334 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  31.8 
 
 
343 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  31.96 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  29.78 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  29.15 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  30.06 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  33.93 
 
 
300 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  31.37 
 
 
312 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.32 
 
 
347 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  32.64 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  29.45 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  32.1 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  33.08 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  29.85 
 
 
327 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  33.2 
 
 
309 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  28.4 
 
 
344 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  29.25 
 
 
355 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  29.31 
 
 
334 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 
334 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.78 
 
 
330 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  29.09 
 
 
330 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.69 
 
 
330 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02622  Isopenicillin N synthetase (EC 1.21.3.1)(Isopenicillin N synthase)(IPNS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05326]  28.92 
 
 
331 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  26.05 
 
 
350 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.44 
 
 
330 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  30.88 
 
 
353 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  32.39 
 
 
323 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  31.14 
 
 
343 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
326 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  34.72 
 
 
311 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  31.47 
 
 
406 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  29.36 
 
 
340 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 
338 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  30.29 
 
 
319 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.59 
 
 
328 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  29.21 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  29.26 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>