More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1269 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  85.48 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  81.12 
 
 		 248 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  80.72 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  77.91 
 
 		 248 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  74.3 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  75.1 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  76.71 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  73.09 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  76.71 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  76.71 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  64.92 
 
 		 247 aa  329  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  62.5 
 
 		 248 aa  328  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  64.11 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  63.71 
 
 		 247 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  62.9 
 
 		 247 aa  323  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  64.26 
 
 		 248 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  64.26 
 
 		 248 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  64.26 
 
 		 248 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  62.1 
 
 		 247 aa  322  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  63.86 
 
 		 248 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  63.71 
 
 		 246 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  63.71 
 
 		 246 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  63.71 
 
 		 246 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  63.71 
 
 		 246 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  61.29 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  63.71 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  62.25 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  61.29 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  63.31 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  63.31 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  61.85 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  63.31 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  60.89 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  61.85 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  61.45 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  61.45 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  59.84 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  60.89 
 
 		 248 aa  307  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  61.29 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  60.48 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  61.29 
 
 		 247 aa  304  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  60.89 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  59.02 
 
 		 246 aa  295  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  58.47 
 
 		 249 aa  294  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  57.79 
 
 		 246 aa  295  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  58.02 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  58.06 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  59.04 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  58.63 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  56.33 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  62.1 
 
 		 249 aa  286  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  56.33 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  58.23 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  57.6 
 
 		 248 aa  285  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  60.89 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  60.08 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  55.65 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  58.4 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  55.24 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  58.61 
 
 		 245 aa  269  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  57.5 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  57.5 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  57.56 
 
 		 239 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  57.79 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  55.24 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  55.24 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  52.82 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  57.14 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  54.22 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  57.32 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  54.03 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  55.24 
 
 		 248 aa  258  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  55.42 
 
 		 239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  59.26 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  59.26 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  59.26 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  55.02 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  59.67 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  53.44 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  58.85 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  55.2 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  59.26 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>