More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4196 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
366 aa  745    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
383 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
377 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 
398 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
382 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
399 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.91 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
373 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.5 
 
 
745 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
374 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
394 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.79 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
364 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
403 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 
386 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
536 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
364 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
414 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
370 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
409 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
360 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.68 
 
 
346 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.44 
 
 
367 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
381 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  28.75 
 
 
342 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
374 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.47 
 
 
388 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
364 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
377 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
387 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
374 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
374 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
382 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
750 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
419 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
375 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  38.59 
 
 
384 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
417 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
413 aa  99.8  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
372 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
374 aa  99.4  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
409 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
358 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
390 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
433 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
1080 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.57 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  32.22 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
401 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
385 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
392 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
364 aa  96.7  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
384 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  32.13 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
369 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  26.09 
 
 
379 aa  96.3  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
440 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
408 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
369 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  36.84 
 
 
411 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>