More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3509 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3509  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
314 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.627575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 
288 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  33.22 
 
 
301 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  34.47 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 
293 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.04 
 
 
294 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  31.76 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  33.1 
 
 
284 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  34.07 
 
 
290 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  32.98 
 
 
291 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 
290 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  32.86 
 
 
292 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
285 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
285 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  32.51 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  29.73 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  34.21 
 
 
289 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
279 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 
284 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  37.63 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  37.63 
 
 
278 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  35.14 
 
 
271 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  31.14 
 
 
299 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  32.16 
 
 
292 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 
284 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 
292 aa  142  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  32.73 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  34.43 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
263 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.47 
 
 
294 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  32.86 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  32.71 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  37.37 
 
 
282 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  34.43 
 
 
271 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  29.69 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  32.1 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  30 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  31.11 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  37.06 
 
 
305 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  34.89 
 
 
279 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 
277 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  32.97 
 
 
267 aa  135  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  32.36 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  33.71 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 
278 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  36.49 
 
 
297 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  32.61 
 
 
276 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  32.87 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  35.4 
 
 
280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 
272 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  30.32 
 
 
298 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  30.88 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  32.12 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  32.47 
 
 
272 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 
264 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  30.45 
 
 
275 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 
286 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  30.8 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3555  ribosomal RNA adenine methylase transferase  32.41 
 
 
277 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.819299  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  35.07 
 
 
298 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  30.26 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  32.34 
 
 
267 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 
297 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 
316 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  31.62 
 
 
268 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  31.73 
 
 
270 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  35.53 
 
 
249 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
297 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  31.99 
 
 
266 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
284 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  32.93 
 
 
271 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  32.71 
 
 
284 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
284 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 
283 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 
280 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  27.56 
 
 
275 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  33.22 
 
 
274 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  31.23 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1091  dimethyladenosine transferase  33.84 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  30.74 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  26.43 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  31.85 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  31.62 
 
 
267 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>