149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1579 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  50.83 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  48.96 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  50.79 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  51.03 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  50.41 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  51.61 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  49.17 
 
 		 244 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  49.17 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  49.17 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  49 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  49.19 
 
 		 259 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  50.41 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  48.13 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  49 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  48.78 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  50.21 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  49 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  51.24 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  51.61 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  48.77 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  50.43 
 
 		 264 aa  225  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  49.77 
 
 		 244 aa  224  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  46.89 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  46.06 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  49.08 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  44 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  42.52 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  42.52 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  43.03 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  44.86 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  48.82 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  43.61 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  43.38 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  37.05 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  34.96 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  27.57 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  27.91 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  27.11 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  31.58 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  28.73 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  28.73 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  27.12 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  27.06 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  52  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  26.22 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  34.48 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  25.6 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  27.74 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 634 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  38.03 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.48 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  40 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 810 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.7 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  45.1 
 
 		 710 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.62 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  30 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  30 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>