47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0050 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0050  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.808352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  28.8 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  30.3 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  36.26 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  33.7 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  25.96 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  25.96 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 212 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  41.54 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  39.51 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  34.88 
 
 		 189 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  35.87 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  32.53 
 
 		 167 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  36.08 
 
 		 175 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  34.88 
 
 		 115 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  34.12 
 
 		 172 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  30.85 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  28.44 
 
 		 117 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  34.57 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  36.92 
 
 		 526 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  35.37 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  40.54 
 
 		 161 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  30.08 
 
 		 169 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  29.71 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  24.53 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  42.25 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  28.71 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  26.83 
 
 		 130 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  39.19 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  30.85 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  32.91 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  28.12 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  39.19 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  32.99 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  32.05 
 
 		 179 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  38.03 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 118 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  38.03 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  38.03 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  27.16 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  44.9 
 
 		 169 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  34.09 
 
 		 120 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  32.99 
 
 		 169 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  28.74 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  35.19 
 
 		 179 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>