248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2861 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  100 
 
 
417 aa  806  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  64.95 
 
 
427 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  62.44 
 
 
420 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  64.71 
 
 
425 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  64.95 
 
 
427 aa  507  1e-142  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.61858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  64.01 
 
 
414 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  64.49 
 
 
427 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  62.59 
 
 
414 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  59.21 
 
 
420 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.84803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  59.44 
 
 
420 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.39256e-10  n/a   
 
 
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  64.78 
 
 
423 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  64.78 
 
 
423 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  64.78 
 
 
423 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  58.64 
 
 
419 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.83947e-06  hitchhiker  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  62.2 
 
 
418 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.24283e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  56 
 
 
422 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  58.88 
 
 
419 aa  466  1e-130  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  57.94 
 
 
419 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  4.73709e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  58.92 
 
 
419 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.31174e-08  unclonable  5.78399e-12 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  54.69 
 
 
422 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  59.11 
 
 
419 aa  458  1e-128  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.93425e-05  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  58.18 
 
 
419 aa  459  1e-128  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.65727e-08  hitchhiker  5.17288e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  58.18 
 
 
419 aa  458  1e-128  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01153e-05  unclonable  2.54337e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  58.18 
 
 
419 aa  459  1e-128  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.52943e-08  unclonable  1.04739e-10 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  57.94 
 
 
419 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.7854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  57.86 
 
 
419 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  58.64 
 
 
419 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.46598e-08  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  57.48 
 
 
419 aa  454  1e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.94256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  53.99 
 
 
422 aa  451  1e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  57.48 
 
 
419 aa  454  1e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.90778e-07  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  56.24 
 
 
432 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  57.35 
 
 
402 aa  445  1e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  61.88 
 
 
425 aa  445  1e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  55.77 
 
 
404 aa  445  1e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  62.82 
 
 
425 aa  445  1e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  56.78 
 
 
419 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.98644e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  57.6 
 
 
403 aa  447  1e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  55.18 
 
 
403 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  53.27 
 
 
406 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  55.31 
 
 
402 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  54.59 
 
 
402 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.13486e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  53.86 
 
 
402 aa  431  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  55.31 
 
 
402 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  57.14 
 
 
408 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  52.59 
 
 
425 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  52.12 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  54.74 
 
 
420 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  52.45 
 
 
405 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  52.05 
 
 
408 aa  407  1e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  49.53 
 
 
424 aa  401  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  49.04 
 
 
419 aa  400  1e-110  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  50.86 
 
 
399 aa  400  1e-110  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  51.23 
 
 
402 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  51.23 
 
 
402 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  51.34 
 
 
402 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  51.59 
 
 
402 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  51.1 
 
 
401 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  49.53 
 
 
424 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  49.77 
 
 
426 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  49.53 
 
 
424 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  49.53 
 
 
424 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  49.3 
 
 
424 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50.49 
 
 
424 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  49.06 
 
 
566 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  50.49 
 
 
424 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  50.49 
 
 
424 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  49.3 
 
 
424 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  49.64 
 
 
408 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  46.75 
 
 
406 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  49.64 
 
 
408 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  51.34 
 
 
401 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  47.42 
 
 
418 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  53 
 
 
371 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  51.33 
 
 
408 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  4.12566e-06 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  49.76 
 
 
403 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.31054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  48.8 
 
 
417 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.7 
 
 
413 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.13 
 
 
416 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  49.13 
 
 
416 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.74 
 
 
416 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  48.06 
 
 
403 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.45183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  47.82 
 
 
403 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.34447e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  47.33 
 
 
403 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.23055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  47.48 
 
 
415 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  47.43 
 
 
401 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  46.17 
 
 
416 aa  353  3e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.33 
 
 
412 aa  352  6e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  48.72 
 
 
401 aa  352  9e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  45.22 
 
 
416 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.93356e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  45.22 
 
 
416 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  45.22 
 
 
416 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  44.98 
 
 
416 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  44.98 
 
 
416 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  44.74 
 
 
416 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  44.74 
 
 
416 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  44.5 
 
 
415 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  45.93 
 
 
416 aa  339  6e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  45.93 
 
 
416 aa  339  6e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  45.93 
 
 
416 aa  339  6e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  47.82 
 
 
403 aa  338  1e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.39018e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>