55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2420 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  60.97 
 
 		 354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  53.39 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  53.39 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  42.94 
 
 		 376 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  42.66 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  41.27 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  40.17 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  38.31 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  39.72 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  40.28 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  38.61 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  40.11 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  39.83 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  39.83 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  39.94 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  39.94 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  39.83 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  39.94 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  39.83 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  40 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  39.55 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  39.94 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  39.55 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  40.56 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  39.11 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  38.55 
 
 		 367 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  40.91 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  38.5 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  38.5 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  40.34 
 
 		 389 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  40.5 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  38.07 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  36.24 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  37.25 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  39.67 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  37.08 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  27.97 
 
 		 384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.21 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  29.55 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  25.41 
 
 		 413 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  27.2 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  29.71 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.03 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  27.87 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  24.43 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.58 
 
 		 748 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  24.04 
 
 		 439 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  27.14 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  24.05 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  22.22 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  30.15 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  24.74 
 
 		 934 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>