More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4798 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  76.86 
 
 		 255 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  72.94 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  77.25 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  76.86 
 
 		 255 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 		 255 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  76.08 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  70.98 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  44.02 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  48.62 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  42.75 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  47.1 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  49.22 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  45.38 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  45.38 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  44.98 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  44.58 
 
 		 288 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  45.8 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  48.18 
 
 		 277 aa  188  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  44.03 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  41.63 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  41.31 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  43.58 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  44.18 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.41 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  40.91 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  44.53 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  45.31 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  44.05 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 		 424 aa  178  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.96 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  44.9 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.94 
 
 		 414 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 536 aa  175  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.28 
 
 		 455 aa  175  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.66 
 
 		 266 aa  174  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 490 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  45.04 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  41.76 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  43.89 
 
 		 273 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.31 
 
 		 272 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.6 
 
 		 418 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  44.91 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.55 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  37.5 
 
 		 416 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  37.98 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  39.15 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  39.15 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  39.77 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  43.36 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.1 
 
 		 405 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  40.78 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  43.33 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.55 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  43.56 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  37.07 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  45.7 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.72 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  40.89 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 		 418 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  42.86 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  43.19 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>