More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3867 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  61.22 
 
 		 202 aa  241  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  58.59 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  53.33 
 
 		 202 aa  220  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  52.31 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  56.74 
 
 		 205 aa  201  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  47.57 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  48.66 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.67 
 
 		 207 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  50.28 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  48.09 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  48.09 
 
 		 198 aa  184  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  48.31 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  48.6 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  41.92 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  44.95 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  44.86 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  47.16 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  48.95 
 
 		 266 aa  164  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  47.88 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.25 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  45.09 
 
 		 220 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  48.95 
 
 		 266 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  41.41 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  46.07 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  43.68 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  43.68 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.02 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  41.58 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  45.88 
 
 		 325 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  42.05 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  41.76 
 
 		 248 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  43.55 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  41.52 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  40.46 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.09 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  42.39 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  43.81 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  43.78 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.97 
 
 		 205 aa  140  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.94 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  40.68 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  42.13 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  42.13 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  40.88 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  35.63 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  42.13 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  35.2 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  34.55 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.46 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  36.87 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  36.26 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  37.3 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  36.26 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  43.79 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  33.68 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  36.13 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  42.13 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  36.07 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  42.68 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  35.05 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  37.57 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  41.32 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  46.41 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  43.2 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.79 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  33.84 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  43.62 
 
 		 224 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  37.79 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  37.1 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  36.46 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  37.77 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  33.87 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  43.93 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  40.23 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  40.23 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.76 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  34.72 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  35.45 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  36.72 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  38.89 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.76 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  35.57 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  39.66 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  41.72 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  40 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.24 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1869  alkaline phosphatase  37.43 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  37.42 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.61 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.38 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  32.24 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  32.24 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  36.09 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  32.24 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>