163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2212 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  699    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  61.29 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  59.83 
 
 		 353 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  54.65 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  59.27 
 
 		 353 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  54.08 
 
 		 356 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  62.37 
 
 		 351 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  50.41 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  47.16 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  53.96 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  45.65 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  45.26 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  44.29 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  44.97 
 
 		 386 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  45.98 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  44.2 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  45.82 
 
 		 390 aa  262  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  45.56 
 
 		 363 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  44.2 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  44.2 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  45.24 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  50 
 
 		 367 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  46.46 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  44.35 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  44.76 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  44.07 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  42.7 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  39.11 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  46.33 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  46.8 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  51.16 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  48.26 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  43.82 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  50.29 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  46.56 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  50 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  48.7 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  43.68 
 
 		 369 aa  232  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  37.04 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  48.1 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  37.73 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  41.06 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  32.84 
 
 		 349 aa  208  9e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  44.19 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  36.17 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  35.91 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  34.41 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  31.16 
 
 		 515 aa  182  8.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  29.46 
 
 		 504 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.46 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  30.17 
 
 		 393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  24.5 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  32.77 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.25 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.44 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  33.23 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  34.38 
 
 		 394 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  31.08 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  27.58 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  33.07 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  27.62 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.81 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.13 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  32.68 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  29.47 
 
 		 424 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  32.01 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  26.69 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  26.79 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  29.17 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  28.89 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  29.41 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  30.03 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  30.84 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  31.11 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  32.3 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  32.3 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  30.68 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  30.23 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  30.73 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  32.58 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  26.58 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  32.76 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  31.4 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  29.14 
 
 		 394 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  31.46 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  30.4 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  30.48 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  30.46 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  33.62 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  33.6 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  31.07 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  31.36 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  31.36 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  29.16 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  29.71 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>