170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1831 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 314 aa  616  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 		 315 aa  248  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  44.41 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  41.27 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  43.58 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 345 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  34.08 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  32.8 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  39.14 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  32.89 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  28.66 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  32.39 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  33.89 
 
 		 344 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  30.34 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  32.09 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  32.55 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  28.53 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  29.61 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  29.33 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  30.71 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  30.77 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  33.76 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  30.9 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  29.93 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  31.85 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  33.67 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  30.7 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  31.85 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  31.33 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  31.33 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  31.68 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  30.03 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  31.53 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  29.43 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  29.43 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  29.43 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  29.43 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  29.11 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  32.58 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  25.33 
 
 		 334 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  26.12 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  31.16 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  25.86 
 
 		 638 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  22.88 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  36.28 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  24.83 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  37.93 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  37.72 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  29.03 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  27.64 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  24.83 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  27.64 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  37.5 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  33.87 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>