89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1663 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.73 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.42 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  43.66 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  32.88 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.44 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  39.76 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  37.97 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.56 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.43 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.98 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  39.47 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.48 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  38.75 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  41.38 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  38.03 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  32.93 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  39.44 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  31.87 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 		 285 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  35.29 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  37.1 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.97 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.31 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  31.71 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  33.05 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  38.71 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.29 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  40.62 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.9 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.55 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.7 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.57 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  31.88 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  30.77 
 
 		 401 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.68 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.43 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  37.68 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.23 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.75 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  26.09 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.21 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  33.77 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0896  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.62 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.14 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.76 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  32 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.76 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  31.33 
 
 		 521 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.71 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.6 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.71 
 
 		 521 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.47 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.59 
 
 		 289 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  34.95 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.24 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.23 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.93 
 
 		 521 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.91 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.38 
 
 		 289 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.333878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  30.93 
 
 		 303 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 		 506 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  30.49 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.31 
 
 		 100 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>