100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4801 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
105 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.67 
 
 
115 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.67 
 
 
107 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  67.62 
 
 
110 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.19 
 
 
105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  66.02 
 
 
132 aa  147  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  62.86 
 
 
105 aa  144  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.19 
 
 
105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.17 
 
 
105 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.17 
 
 
105 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.19 
 
 
114 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  49.5 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.47 
 
 
108 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  44.57 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  44.12 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  46.39 
 
 
117 aa  84.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.24 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  45.83 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  41.58 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.59 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  39.58 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  41.12 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  45.88 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  43.81 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  39.8 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  37.5 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.54 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.05 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  38.78 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  39.39 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  37.38 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.67 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.38 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.54 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.49 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  36.11 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.76 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.38 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  38.38 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  32.65 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.37 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  37.5 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.08 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  38.71 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  35.71 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.71 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.31 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  34.09 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.21 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.66 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.13 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  39.06 
 
 
401 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.78 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  34.34 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  29.59 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  30.43 
 
 
420 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.24 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  25.24 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.68 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  33.73 
 
 
289 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.1 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.21 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.63 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  37.66 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  26.8 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  34.21 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.31 
 
 
371 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
171 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.63 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  27.78 
 
 
311 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>