116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1174 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  290  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  68.25 
 
 
144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  41.96 
 
 
149 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  40.17 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.88 
 
 
153 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.76 
 
 
149 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.97 
 
 
217 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.41 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.92 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  36.44 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  37.96 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  36.17 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.75 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.32 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.45 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  32.35 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.36 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.24 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.24 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.27 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.92 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  32.46 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.85 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  38 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.98 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  34.69 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.95 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.11 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.86 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  36 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  35 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  34.58 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  38.16 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  35.71 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  38.46 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.07 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.79 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.67 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.01 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.86 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  32.74 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  31.3 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.95 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.95 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.95 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.95 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.95 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.95 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  38.57 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.25 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.61 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  32.63 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  41.38 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  36.84 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  30.84 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.86 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.46 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.28 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  29.41 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  32.65 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.36 
 
 
125 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.46 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
125 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  35.9 
 
 
289 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.92 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  35.53 
 
 
420 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.31 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  33.75 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.04 
 
 
289 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  39.13 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_325  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  41.54 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.168173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0381  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000348329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.04 
 
 
289 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0363  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
132 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.63 
 
 
289 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.31 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.31 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0896  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.89 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>