115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4829 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
119 aa  245  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  51.82 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  44.74 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  43.75 
 
 
120 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.82 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  42.99 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.55 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  40.18 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.4 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.86 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.37 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  36.04 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  39.18 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  39.22 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.71 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  41.49 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  33.63 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  43.4 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.18 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.18 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  35.65 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  35.51 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.42 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.37 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.45 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.51 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  33.64 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.43 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.89 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.79 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.62 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  39.44 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  33.91 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.91 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.76 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  31.68 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.58 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.27 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.88 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.51 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.51 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.25 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  36.45 
 
 
420 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  35.21 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.43 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.94 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.94 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.94 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.94 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.94 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.94 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.09 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.37 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  30.49 
 
 
134 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.18 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  32.5 
 
 
401 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.83 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  31.71 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  29.36 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.41 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  53.49 
 
 
151 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.47 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.27 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  33.68 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.27 
 
 
289 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.74 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.67 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.04 
 
 
304 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0250  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.172356  normal  0.341461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.14 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  31.82 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.48 
 
 
296 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  31.33 
 
 
111 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>