52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0250 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0250  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 96 aa  201  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.172356  normal  0.341461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.63 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  34.74 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0893  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.21 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203676  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  35.8 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.14 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.49 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  36.49 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.03 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  31.46 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.28 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.17 
 
 		 270 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  36.23 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  34.78 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 527 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  30.43 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  26.32 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.82 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.81 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.78 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.48 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 		 160 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.94 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.53 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3220  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 508 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  27.96 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.98 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.46 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  25.51 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.75 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.92 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.48 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.94 
 
 		 518 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1673  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.89 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  35.29 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.79 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.56 
 
 		 107 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  38.1 
 
 		 104 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.72 
 
 		 512 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.72 
 
 		 512 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>