88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2437 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  72.09 
 
 		 134 aa  200  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  66.67 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.83 
 
 		 130 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.96 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.85 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.64 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  60 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.71 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.2 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.2 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.4 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  58.4 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  58.4 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.6 
 
 		 133 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  60.33 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  60.33 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  60.33 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  60.33 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  60.33 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  60.33 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  57.63 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  50.93 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  54.55 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.14 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  57.14 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  48.67 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.38 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.29 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  50.48 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 		 123 aa  116  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  48.7 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.52 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.25 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.8 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  35.92 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.19 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.04 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  41.9 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  37.96 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  37.74 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.37 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.04 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.85 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  43.75 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.76 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.63 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.73 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  35.71 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  40.66 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  39.02 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.58 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  37.8 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  32.11 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  42.25 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.9 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.44 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  35.71 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.24 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.59 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  34.74 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.52 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.13 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.73 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  35.44 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.86 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.63 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.39 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  36.36 
 
 		 420 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>