128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0744 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  215  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  83.81 
 
 
105 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  83.81 
 
 
114 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  82.86 
 
 
105 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  68.93 
 
 
115 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  67.96 
 
 
107 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  65.35 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.05 
 
 
105 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  63.73 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  60.19 
 
 
105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  59.62 
 
 
105 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  43.48 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.86 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  42.22 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  44.66 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.53 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.54 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  42.71 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.83 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  44.68 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.94 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.63 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  34.62 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  40.51 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.54 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.45 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.45 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.77 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.46 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.77 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  36.45 
 
 
116 aa  66.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.34 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.42 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  37.38 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  34.55 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.42 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.42 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.42 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.42 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.42 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  42.11 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  29.73 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  36.67 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  39.62 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.05 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.69 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  35.35 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  36.45 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.05 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.73 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  35.96 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.89 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
217 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  34.26 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  43.06 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.18 
 
 
116 aa  59.3  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.87 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  32.61 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  31.37 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.36 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  32.65 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  31.51 
 
 
401 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  34.83 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  38.37 
 
 
289 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.53 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.37 
 
 
301 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.59 
 
 
286 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.02 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  42.37 
 
 
296 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  27.37 
 
 
291 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  35.14 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  28.92 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
285 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  31.58 
 
 
311 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.21 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3224  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
411 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.841797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>