92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5489 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  100 
 
 		 119 aa  247  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  47.62 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.74 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.2 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.93 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  38.74 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  39.18 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.22 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.22 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.54 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  39.58 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  37.89 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  35.58 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.71 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  33.68 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.48 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.48 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.96 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  31.53 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  35.71 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  31.53 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  32.17 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.04 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.4 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  33.75 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.72 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.98 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.72 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  31.73 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  34.34 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  30.34 
 
 		 401 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.43 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.43 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  32.48 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.97 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  30.48 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.41 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.3 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  32.73 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.48 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  30.69 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  30.48 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  33.78 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.78 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  34.34 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.11 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.97 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.97 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.63 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.03 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.57 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.53 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  30.77 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  32.99 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.99 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.29 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 		 182 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.51 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  32.91 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 521 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>