More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1040 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
623 aa  676  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 
592 aa  725  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.9189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 
599 aa  640  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  4.68378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 
610 aa  748  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
605 aa  662  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 
603 aa  657  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
600 aa  675  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
604 aa  637  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
591 aa  704  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
617 aa  661  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
591 aa  704  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.43649e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 
614 aa  741  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
596 aa  672  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 
595 aa  647  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 
599 aa  650  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
600 aa  675  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 
595 aa  735  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
627 aa  750  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
597 aa  655  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 
586 aa  712  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.70105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
600 aa  673  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  58 
 
 
594 aa  708  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.73748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 
604 aa  649  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
601 aa  640  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
591 aa  641  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 
594 aa  731  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 
600 aa  672  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
613 aa  744  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 
603 aa  657  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
607 aa  687  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
592 aa  664  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 
590 aa  712  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.46901e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
593 aa  717  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 
594 aa  845  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.45437e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
603 aa  637  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
598 aa  638  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 
600 aa  672  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 
623 aa  674  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
599 aa  669  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 
588 aa  697  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.19088e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
590 aa  654  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.46204e-05  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
599 aa  665  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
600 aa  673  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
589 aa  713  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
600 aa  667  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
598 aa  639  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44023e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
600 aa  673  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 
601 aa  692  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
592 aa  717  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 
591 aa  697  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
600 aa  674  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 
600 aa  645  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 
598 aa  699  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 
585 aa  717  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
589 aa  635  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.43263e-05  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
600 aa  675  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
591 aa  704  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
600 aa  675  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
599 aa  674  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 
600 aa  785  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
591 aa  707  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.91465e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 
599 aa  668  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
596 aa  672  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  2.41419e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 
593 aa  862  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.05553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
603 aa  635  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
591 aa  647  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  65.54 
 
 
598 aa  839  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.05655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  69.19 
 
 
593 aa  877  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.00775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
602 aa  708  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 
588 aa  697  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.35097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
591 aa  635  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
597 aa  783  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.45499e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
593 aa  856  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
591 aa  704  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
595 aa  655  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
594 aa  645  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 
600 aa  672  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
591 aa  707  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 
605 aa  677  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  68.24 
 
 
594 aa  869  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12068e-12  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 
606 aa  738  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
591 aa  705  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.582e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 
590 aa  699  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
597 aa  715  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
599 aa  645  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 
588 aa  682  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
602 aa  741  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
598 aa  674  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
614 aa  644  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 
591 aa  703  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
600 aa  675  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
593 aa  640  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
593 aa  638  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 
591 aa  635  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  2.71682e-05  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
591 aa  705  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 
591 aa  635  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
592 aa  648  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  3.66729e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
599 aa  672  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.13965e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
618 aa  640  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
596 aa  646  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  6.26629e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>