56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0736 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0736  ATPase  100 
 
 
443 aa  879    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  41.41 
 
 
457 aa  277  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  35.73 
 
 
469 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  37.84 
 
 
458 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  37.97 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  33.33 
 
 
463 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  35.73 
 
 
464 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  35.77 
 
 
456 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  40.36 
 
 
460 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  32.08 
 
 
461 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  37.5 
 
 
464 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  35.66 
 
 
496 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  36.97 
 
 
462 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  32.29 
 
 
463 aa  219  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  34.05 
 
 
464 aa  218  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  34.43 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  33.94 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  32.56 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  34.8 
 
 
463 aa  213  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  37.69 
 
 
470 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  34.59 
 
 
463 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  37.16 
 
 
431 aa  206  7e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  32.79 
 
 
420 aa  193  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  30.37 
 
 
471 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  34.52 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  33.08 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  28.14 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  30.68 
 
 
469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  30.73 
 
 
456 aa  176  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  33.57 
 
 
439 aa  170  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  29.06 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  29.91 
 
 
462 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  29.03 
 
 
478 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.38 
 
 
509 aa  133  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  29.44 
 
 
476 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  28.57 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  29.31 
 
 
487 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  34.85 
 
 
454 aa  127  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  32.08 
 
 
472 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  30.34 
 
 
407 aa  113  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  29.79 
 
 
472 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  26.91 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  26.67 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  26.85 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  27.17 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  25.9 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  24.35 
 
 
501 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  25.85 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.28 
 
 
474 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  31.8 
 
 
359 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1130  ATPase  24.4 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  25.4 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  31.9 
 
 
374 aa  43.9  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  29.39 
 
 
342 aa  43.5  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1786  hypothetical protein  22.13 
 
 
415 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00688382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>