72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03231 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  907  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  54.61 
 
 
473 aa  446  1e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  38.61 
 
 
474 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
455 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  36.99 
 
 
465 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  35.82 
 
 
470 aa  223  5e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  35.68 
 
 
466 aa  220  4e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  35.68 
 
 
466 aa  220  4e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  35.68 
 
 
466 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  35.68 
 
 
466 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  35.68 
 
 
466 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  35.68 
 
 
466 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.04 
 
 
475 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  34.56 
 
 
442 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.22 
 
 
443 aa  216  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  34.44 
 
 
466 aa  214  2e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
445 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  33.11 
 
 
445 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  35.06 
 
 
471 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  35.93 
 
 
444 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.31 
 
 
883 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  33.05 
 
 
456 aa  202  1e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  33.63 
 
 
455 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  35.23 
 
 
473 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  31.97 
 
 
453 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  34.57 
 
 
462 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  32.97 
 
 
467 aa  189  6e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  31.39 
 
 
470 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.37 
 
 
455 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  36.06 
 
 
460 aa  186  1e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  32.82 
 
 
469 aa  185  1e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  33.04 
 
 
469 aa  184  2e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.91 
 
 
481 aa  185  2e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.56 
 
 
460 aa  183  5e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.56 
 
 
460 aa  183  5e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  33.19 
 
 
471 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  31.83 
 
 
467 aa  181  3e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.56 
 
 
468 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  37.84 
 
 
1751 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.94 
 
 
453 aa  174  3e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.37 
 
 
474 aa  171  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  31.64 
 
 
454 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
523 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.29 
 
 
482 aa  156  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
480 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
485 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.91 
 
 
479 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  30.2 
 
 
466 aa  148  2e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  28.94 
 
 
499 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
478 aa  136  7e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  28.64 
 
 
478 aa  135  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  28.17 
 
 
468 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.95 
 
 
468 aa  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.42 
 
 
506 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  25.54 
 
 
458 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  27.92 
 
 
633 aa  80.5  6e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  27.29 
 
 
490 aa  77.8  4e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  23.14 
 
 
507 aa  58.9  2e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.18 
 
 
608 aa  57  6e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  30.14 
 
 
477 aa  53.5  7e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
479 aa  52.8  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  35.16 
 
 
125 aa  51.6  3e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0945  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  51.2  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0341788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0964  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  51.2  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000255426  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  18.12 
 
 
494 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4135  hypothetical protein  26.17 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.124119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.65 
 
 
500 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.65 
 
 
500 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  26.19 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  3.0745e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  26.19 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.14791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  34.74 
 
 
483 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  32.14 
 
 
239 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>