More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02363 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  100 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  87.2 
 
 		 128 aa  219  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  83.87 
 
 		 151 aa  216  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  83.06 
 
 		 151 aa  213  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  64.75 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  65.04 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  63.41 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  61.11 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  61.79 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  62.7 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  60.98 
 
 		 126 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  62.3 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  61.79 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  61.79 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 126 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 126 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  59.68 
 
 		 128 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  60.16 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  58.2 
 
 		 128 aa  150  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  59.35 
 
 		 126 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  56.69 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  59.17 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  55.2 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  58.2 
 
 		 127 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  60.8 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  55.28 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  54.92 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  56.56 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  54.47 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 128 aa  140  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  54.76 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  51.2 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  50 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  54.17 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  53.51 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  54.4 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  51.56 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  50.78 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  49.61 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  49.61 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  52.85 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>