More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5453 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  100 
 
 
335 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  95.22 
 
 
335 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  81.49 
 
 
337 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  75.52 
 
 
336 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  76.12 
 
 
336 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  74.93 
 
 
336 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  63.28 
 
 
337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  61.79 
 
 
339 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  60 
 
 
336 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  61.75 
 
 
349 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  60.54 
 
 
359 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  60.54 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  60.48 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  59.34 
 
 
336 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
335 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  60.3 
 
 
334 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  58.81 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  59.04 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  58.33 
 
 
335 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  58.13 
 
 
342 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  54.33 
 
 
349 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  54.19 
 
 
341 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  53.59 
 
 
333 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  51.81 
 
 
342 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  52.91 
 
 
332 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  52.11 
 
 
354 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  52.11 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  44.1 
 
 
343 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
343 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  41.05 
 
 
327 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
340 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  41.69 
 
 
341 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
331 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  41.29 
 
 
317 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
333 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.45 
 
 
332 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
348 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
326 aa  227  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
345 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
322 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
325 aa  225  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
337 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  40.5 
 
 
349 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.21 
 
 
343 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  39.06 
 
 
352 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
331 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.42 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
341 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.5 
 
 
331 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.38 
 
 
343 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.02 
 
 
344 aa  219  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  39.07 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
333 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
344 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  37.72 
 
 
351 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  40.54 
 
 
326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.12 
 
 
336 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
344 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  37.38 
 
 
327 aa  212  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  35.16 
 
 
343 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  36.2 
 
 
343 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  38.56 
 
 
334 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  37.43 
 
 
334 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  39.04 
 
 
326 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  38.98 
 
 
313 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
368 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
350 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
341 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.06 
 
 
333 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  37.65 
 
 
325 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
323 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  36.45 
 
 
343 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
336 aa  209  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
327 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  38.86 
 
 
352 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
339 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
339 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
339 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
332 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
324 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  37.23 
 
 
326 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.69 
 
 
327 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
326 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  37.79 
 
 
316 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.29 
 
 
355 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.13 
 
 
339 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
332 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>