200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2734 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  100 
 
 
340 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  93.82 
 
 
340 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  65.29 
 
 
344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  64.71 
 
 
383 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  65.29 
 
 
344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  64.41 
 
 
344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  65.15 
 
 
333 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  46.9 
 
 
340 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  31 
 
 
309 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  36.46 
 
 
337 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  36.18 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  37.11 
 
 
338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  34.2 
 
 
342 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  36.55 
 
 
367 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  36.77 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  31.16 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  31.9 
 
 
354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  33.55 
 
 
356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  33.14 
 
 
342 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  34.84 
 
 
364 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  35.71 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  33.03 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  32.09 
 
 
354 aa  119  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  32.86 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  33.33 
 
 
327 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  32.76 
 
 
378 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  31.04 
 
 
354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  31.74 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  31.29 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  33.87 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  31.59 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  32.53 
 
 
382 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  32.75 
 
 
335 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  30.23 
 
 
351 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  30.96 
 
 
335 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  33.01 
 
 
375 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  32.27 
 
 
336 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  29.22 
 
 
357 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.52 
 
 
391 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  30.48 
 
 
377 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.46 
 
 
383 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  31.32 
 
 
363 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  29.22 
 
 
395 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  29.22 
 
 
395 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  33.15 
 
 
366 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  30.54 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  29.97 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  27.27 
 
 
360 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  31.63 
 
 
357 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.1 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  27.78 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  31.94 
 
 
368 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  30.65 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.65 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  28.25 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  28.18 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  28.57 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  29.33 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  26.93 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  33.17 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  26.69 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  29.21 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  29.91 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  27.87 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  27.27 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  28.1 
 
 
408 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  28.72 
 
 
362 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  26.2 
 
 
380 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  31.74 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  30.56 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  31.53 
 
 
430 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  26.88 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  25.49 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  27.3 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  31.43 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  23.81 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  26.69 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  28.12 
 
 
508 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  23.81 
 
 
381 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  26.38 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  26.44 
 
 
395 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  23.81 
 
 
408 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  31.06 
 
 
403 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  32.2 
 
 
423 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  27.01 
 
 
371 aa  56.6  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  36.22 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  24.5 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  26.8 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  30.49 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  28.65 
 
 
437 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  29.78 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  28.99 
 
 
629 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2813  acyltransferase family protein  27.52 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  28.99 
 
 
647 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0036  acyltransferase family protein  27.52 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1730  acyltransferase family protein  27.52 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3164  acyltransferase family protein  27.52 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  27.41 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3620  acyltransferase family protein  27.75 
 
 
400 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.775575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3608  putative acyltransferase  27.75 
 
 
372 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>