More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3717 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  85.25 
 
 		 244 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.67 
 
 		 237 aa  311  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  70.4 
 
 		 226 aa  308  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  57.71 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 231 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  58.67 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  58.18 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  58.64 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  58.59 
 
 		 232 aa  261  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 228 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  56.31 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  53.1 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  53.1 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  53.1 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  53.1 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  53.1 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  53.1 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  53.1 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  53.1 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 232 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  54.22 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  49.56 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  50.45 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  49.35 
 
 		 231 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.15 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.29 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 230 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.73 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  47.3 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.8 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  43.86 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.06 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  47.09 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  45.54 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.34 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  48.46 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 229 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  46.15 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  46.15 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.15 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  45.7 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.15 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4479  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.874583  hitchhiker  0.00000000145831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>