More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1210 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  96.85 
 
 		 317 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 315 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  73.86 
 
 		 315 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  73.86 
 
 		 315 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  74.51 
 
 		 315 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  73.86 
 
 		 322 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  73.86 
 
 		 315 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  73.53 
 
 		 332 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  64.19 
 
 		 312 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  63.23 
 
 		 312 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 312 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 313 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 313 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  64.05 
 
 		 313 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  68.51 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  63.4 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  64.05 
 
 		 313 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  64.05 
 
 		 313 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  68.51 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  61.54 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  61.54 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  63.96 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  62.06 
 
 		 313 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 334 aa  394  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  57.28 
 
 		 331 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 331 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 315 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 315 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 315 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  55.99 
 
 		 332 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 322 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 323 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 323 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 323 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 323 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 323 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 323 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 430 aa  322  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 322 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 318 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 323 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  51.16 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 322 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  52.29 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  51.31 
 
 		 311 aa  311  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 323 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  41.58 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 351 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>