More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0937 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  86.17 
 
 		 315 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  86.17 
 
 		 315 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  86.5 
 
 		 315 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  85.21 
 
 		 315 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  84.39 
 
 		 332 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  83.76 
 
 		 315 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  73.86 
 
 		 317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  74.18 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  65.05 
 
 		 312 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 312 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  64.72 
 
 		 312 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  63.43 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  63.43 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  63.75 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 313 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 313 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 313 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  65.51 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  65.82 
 
 		 314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  62.21 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  57.33 
 
 		 331 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  56.68 
 
 		 331 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 316 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 316 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  53 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  53 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 313 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 313 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 313 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  52 
 
 		 315 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  52 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 312 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  53 
 
 		 355 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 322 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 322 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 430 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  50.16 
 
 		 431 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 308 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  50.5 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.66 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  37.25 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>