More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1265 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  100 
 
 		 382 aa  782    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  80.63 
 
 		 382 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  79.09 
 
 		 381 aa  634    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  84.03 
 
 		 382 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  99.74 
 
 		 382 aa  780    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  80.1 
 
 		 381 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  79.89 
 
 		 377 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  78.88 
 
 		 377 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  79.62 
 
 		 377 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  79.67 
 
 		 373 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  64.92 
 
 		 377 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  65.15 
 
 		 376 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  64.92 
 
 		 377 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  66.22 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  64.61 
 
 		 385 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  64.34 
 
 		 377 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  64.34 
 
 		 377 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  59.95 
 
 		 377 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  50.8 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  45.65 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  42.97 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  42.09 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  42.43 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  41.55 
 
 		 381 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  42.97 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  44.56 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  40.48 
 
 		 456 aa  265  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  40.48 
 
 		 456 aa  265  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.73 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  37.73 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.95 
 
 		 380 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.95 
 
 		 380 aa  252  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 		 380 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.69 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.95 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 		 381 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.94 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  36.2 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 		 426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 427 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  34.34 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  31.68 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 384 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 378 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 		 458 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  34.46 
 
 		 406 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  34.2 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  32.7 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  32.99 
 
 		 378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.81 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.11 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 432 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.11 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 342 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 812 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>