149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56762 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  100 
 
 
334 aa  674    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  63.28 
 
 
334 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  55.02 
 
 
335 aa  368  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  54.68 
 
 
336 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  53.64 
 
 
336 aa  351  8e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  51.94 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  47.92 
 
 
335 aa  315  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  48.21 
 
 
339 aa  311  9e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  44.91 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  43.81 
 
 
334 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  37.39 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  36.81 
 
 
346 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  38.68 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  33.92 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.21 
 
 
348 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
346 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.82 
 
 
347 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
352 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.56 
 
 
341 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.56 
 
 
341 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
346 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
352 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.08 
 
 
351 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
346 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  30.55 
 
 
328 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.08 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  32.85 
 
 
331 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
341 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  30.48 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
319 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  31.4 
 
 
340 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
347 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  31.25 
 
 
354 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
332 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  33.33 
 
 
363 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  33.33 
 
 
363 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
363 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
357 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  26.55 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  30.68 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  27.19 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  31.72 
 
 
358 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  28.49 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  27.99 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  30.32 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  30.32 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  30.34 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  29.45 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  29 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  28.52 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
342 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.32 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
322 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37466  predicted protein  26.22 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  27.38 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.73 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  27.59 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00460  C-3 sterol dehydrogenase (C-4 sterol decarboxylase), putative  25.1 
 
 
448 aa  53.1  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.257092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.52 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
328 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.41 
 
 
329 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  26.55 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.01 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
358 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  26.91 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  26.74 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  26.15 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  24.7 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10818  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000907114  normal  0.897069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  27.86 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.3 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  25.28 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  26.28 
 
 
338 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  27.74 
 
 
329 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.28 
 
 
335 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>