More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0525 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  100 
 
 		 539 aa  1119    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  56.37 
 
 		 534 aa  634    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  59.51 
 
 		 539 aa  689    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  62.06 
 
 		 550 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  59.55 
 
 		 563 aa  655    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  59.4 
 
 		 537 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  61.08 
 
 		 539 aa  712    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  58.52 
 
 		 554 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  63.11 
 
 		 538 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  62.15 
 
 		 539 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  60.45 
 
 		 565 aa  679    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  54.41 
 
 		 541 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  54 
 
 		 542 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  54.7 
 
 		 533 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  55.6 
 
 		 540 aa  611  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  55.64 
 
 		 597 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  52.14 
 
 		 534 aa  605  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  55.79 
 
 		 565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  54.15 
 
 		 531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  53.96 
 
 		 531 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  54.02 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.22 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  54.22 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  54.41 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  54.03 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  53.85 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  53.85 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  51.22 
 
 		 536 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  53.85 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  53.37 
 
 		 534 aa  598  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  53.6 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  51.22 
 
 		 536 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  591  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  53.1 
 
 		 534 aa  594  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  591  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  52.89 
 
 		 535 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  52.89 
 
 		 535 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  52.7 
 
 		 536 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  52.25 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  53.27 
 
 		 545 aa  589  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  54.61 
 
 		 549 aa  588  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  54.43 
 
 		 540 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  54.14 
 
 		 569 aa  590  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  52.42 
 
 		 552 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  52.63 
 
 		 532 aa  586  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  52.64 
 
 		 537 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  52.16 
 
 		 533 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  52.33 
 
 		 547 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  53 
 
 		 542 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  53.05 
 
 		 565 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  52.93 
 
 		 538 aa  587  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  55.26 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  50 
 
 		 535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0090  CTP synthetase  53.38 
 
 		 569 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  51.5 
 
 		 532 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  50.46 
 
 		 544 aa  583  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  51.41 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  52.14 
 
 		 537 aa  581  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  52.69 
 
 		 547 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  52.37 
 
 		 548 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  53.02 
 
 		 530 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  54.51 
 
 		 565 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  52.21 
 
 		 551 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  52.68 
 
 		 550 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  53.12 
 
 		 551 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  51.93 
 
 		 542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  51.47 
 
 		 542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  50.94 
 
 		 534 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  52.35 
 
 		 554 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  51.29 
 
 		 543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  51.32 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  51.47 
 
 		 542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  50.92 
 
 		 543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  51 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  51.12 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  52.11 
 
 		 546 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  51.47 
 
 		 542 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  52.39 
 
 		 550 aa  569  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  52.29 
 
 		 546 aa  568  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  51.3 
 
 		 538 aa  571  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  51.1 
 
 		 542 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  49.81 
 
 		 533 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  50.84 
 
 		 536 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  50.55 
 
 		 543 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  49.91 
 
 		 536 aa  567  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  51.28 
 
 		 547 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  51.85 
 
 		 566 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  50.74 
 
 		 542 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  50.19 
 
 		 559 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  51.01 
 
 		 543 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  50.74 
 
 		 542 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  50.65 
 
 		 535 aa  567  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  51.42 
 
 		 545 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  51.96 
 
 		 548 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  51.48 
 
 		 544 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>