More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4206 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  71.76 
 
 
507 aa  728  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  100 
 
 
520 aa  1051  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  83.4 
 
 
514 aa  847  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  67.79 
 
 
517 aa  651  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  69.3 
 
 
518 aa  704  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  83.4 
 
 
514 aa  847  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  63.73 
 
 
478 aa  578  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  53.36 
 
 
461 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  51.11 
 
 
459 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  53.27 
 
 
465 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  50.91 
 
 
459 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  54.82 
 
 
465 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  50.41 
 
 
457 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  50.41 
 
 
458 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 
484 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  471  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26521  DNA repair protein RadA  57.2 
 
 
464 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  49.59 
 
 
458 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  49.8 
 
 
458 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
458 aa  471  1e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  50.92 
 
 
448 aa  468  1e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 
453 aa  468  1e-130  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  51.92 
 
 
454 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  48.19 
 
 
454 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  48.19 
 
 
454 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.1 
 
 
457 aa  458  1e-128  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 
457 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.27 
 
 
449 aa  453  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49.38 
 
 
453 aa  452  1e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  47.28 
 
 
476 aa  454  1e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  50.21 
 
 
448 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  48.77 
 
 
450 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  50.31 
 
 
450 aa  446  1e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 
449 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  48.47 
 
 
470 aa  441  1e-122  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  46.89 
 
 
453 aa  435  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  47.34 
 
 
465 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  45.78 
 
 
454 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  47.97 
 
 
457 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  45.57 
 
 
452 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.45 
 
 
457 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  46.38 
 
 
450 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 
449 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 
455 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  47.87 
 
 
449 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  46.37 
 
 
450 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  48.07 
 
 
462 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  46.35 
 
 
461 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 
460 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 
459 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.55 
 
 
453 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  51.41 
 
 
408 aa  422  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  47.84 
 
 
446 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  46.89 
 
 
445 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  44.8 
 
 
489 aa  417  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  46.86 
 
 
455 aa  416  1e-115  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  44.85 
 
 
451 aa  416  1e-115  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.62714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  43.17 
 
 
457 aa  418  1e-115  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 
455 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  46.24 
 
 
463 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  45.36 
 
 
450 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 
453 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 
462 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 
447 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  46.44 
 
 
453 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  46.42 
 
 
455 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 
462 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 
462 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  43.56 
 
 
458 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 
453 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  45.34 
 
 
462 aa  408  1e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 
462 aa  405  1e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  45.66 
 
 
451 aa  407  1e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  46.63 
 
 
456 aa  406  1e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.45 
 
 
453 aa  406  1e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  48.37 
 
 
471 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  45.12 
 
 
453 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  47.76 
 
 
464 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  45.34 
 
 
456 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  45.34 
 
 
456 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 
452 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  46.25 
 
 
464 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  45.34 
 
 
456 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  45.32 
 
 
453 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  45.32 
 
 
453 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  46.63 
 
 
456 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  46.25 
 
 
448 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  43.09 
 
 
457 aa  399  1e-110  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  46.22 
 
 
455 aa  400  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  44.61 
 
 
463 aa  400  1e-110  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 
467 aa  400  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 
415 aa  400  1e-110  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  45.62 
 
 
477 aa  401  1e-110  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 
453 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>