More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0095 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  65.97 
 
 
531 aa  735  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
530 aa  1102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 
535 aa  827  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 
535 aa  827  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  67.8 
 
 
530 aa  764  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 
533 aa  761  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 
525 aa  735  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 
530 aa  782  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  5.79293e-05 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
515 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 
516 aa  540  1e-152  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
516 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1140  methionyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
514 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.266684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1334  methionyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 
514 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0404003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09931  methionyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
514 aa  515  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0902215  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09481  methionyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
511 aa  517  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09951  methionyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
514 aa  515  1e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0934  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
511 aa  507  1e-142  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08971  methionyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
509 aa  493  1e-138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.931117  decreased coverage  4.49236e-07 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
632 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.21971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
509 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.4425e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
510 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
648 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
511 aa  472  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
650 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
509 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
650 aa  471  1e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
645 aa  471  1e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.87272e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
512 aa  466  1e-130  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  5.89281e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
508 aa  465  1e-130  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
509 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.97609e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
647 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.5899e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
506 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
526 aa  464  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
655 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
516 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
629 aa  462  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
647 aa  459  1e-128  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
653 aa  460  1e-128  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
654 aa  461  1e-128  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
629 aa  462  1e-128  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.13814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
509 aa  461  1e-128  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70708e-11 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
651 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  7.03201e-06 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
628 aa  458  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
650 aa  457  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
660 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
634 aa  458  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
660 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
519 aa  452  1e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
660 aa  455  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
660 aa  455  1e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
660 aa  455  1e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
660 aa  453  1e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
660 aa  455  1e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
660 aa  455  1e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
638 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
653 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.7518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
660 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
645 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
493 aa  450  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
660 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
529 aa  448  1e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
659 aa  447  1e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
518 aa  447  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.85531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
526 aa  446  1e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
530 aa  445  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
533 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.02629e-05  hitchhiker  2.28434e-05 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
525 aa  440  1e-122  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  41.9 
 
 
574 aa  438  1e-122  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
645 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
634 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
512 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
520 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
538 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
645 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
522 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
506 aa  434  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
522 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
522 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
527 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
523 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
648 aa  431  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  5.47947e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
665 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
656 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
624 aa  425  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
657 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
657 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
511 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
514 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
515 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
500 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
667 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
522 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
516 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
681 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
516 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
516 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
539 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
523 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
506 aa  419  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
642 aa  417  1e-115  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>