133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  84.35 
 
 		 409 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  82.6 
 
 		 413 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  82.6 
 
 		 413 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  84.8 
 
 		 409 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  86.03 
 
 		 409 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  795    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  84.07 
 
 		 409 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  84.07 
 
 		 409 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  96.58 
 
 		 409 aa  777    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  80.88 
 
 		 409 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  85.09 
 
 		 409 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  85.57 
 
 		 409 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  80.88 
 
 		 409 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  57.84 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  60.29 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  60.83 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  60.34 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  59.37 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  60.1 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  60.34 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  60.34 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  59.51 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  57.66 
 
 		 408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  59.85 
 
 		 408 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  59.85 
 
 		 408 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  59.37 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  57.91 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  56.93 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  57.42 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  58.64 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  56.59 
 
 		 408 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  48.44 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  44.61 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  47.24 
 
 		 414 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  48.92 
 
 		 414 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  50.12 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  50.36 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  49.16 
 
 		 414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  45.1 
 
 		 411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  44.12 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  42.14 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  45.05 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  45.05 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  45 
 
 		 415 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  47.23 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  42.89 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  41.94 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  41.14 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  36.36 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  38.4 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  41.67 
 
 		 440 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  36.93 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  43.5 
 
 		 200 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  46.95 
 
 		 180 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  43.48 
 
 		 177 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  43.65 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  43.07 
 
 		 197 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  47.4 
 
 		 176 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  46.79 
 
 		 178 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  49.34 
 
 		 178 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  38.97 
 
 		 195 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  42.94 
 
 		 177 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  40.61 
 
 		 201 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  40.61 
 
 		 201 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  46.67 
 
 		 177 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1195  nucleoside recognition domain-containing protein  45.39 
 
 		 176 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  42.51 
 
 		 198 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  44.72 
 
 		 193 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  44.31 
 
 		 201 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  44.74 
 
 		 176 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  44.74 
 
 		 176 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  44.74 
 
 		 176 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  41.33 
 
 		 194 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  44.74 
 
 		 176 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  44.74 
 
 		 176 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  44.74 
 
 		 176 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  44.74 
 
 		 176 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  44.74 
 
 		 176 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  45.45 
 
 		 179 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1526  spore maturation protein  44.08 
 
 		 176 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3819  spore maturation protein  44.08 
 
 		 176 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  41.92 
 
 		 198 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  43.03 
 
 		 177 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  39.5 
 
 		 194 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  46.15 
 
 		 173 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  46.45 
 
 		 182 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  42.68 
 
 		 194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  43.03 
 
 		 176 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  43.68 
 
 		 199 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  41.27 
 
 		 197 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  43.51 
 
 		 181 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  40.51 
 
 		 176 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  42.42 
 
 		 177 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  50.35 
 
 		 201 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  38.42 
 
 		 210 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  45.21 
 
 		 177 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  37.31 
 
 		 191 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0166  nucleoside recognition domain protein  42.77 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00262141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>