66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  53.39 
 
 		 135 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  44.07 
 
 		 125 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  43.22 
 
 		 125 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  39.09 
 
 		 128 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  41.53 
 
 		 127 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  39.84 
 
 		 133 aa  89  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  30.83 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 120 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  31.09 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 120 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 120 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  29 
 
 		 141 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  34.44 
 
 		 131 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  22.5 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  29.31 
 
 		 121 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  23.73 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  32.43 
 
 		 131 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  21.67 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  21.67 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  21.67 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  21.67 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  21.67 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  21.67 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  21.67 
 
 		 137 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 		 129 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  27.55 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  20.83 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  30.28 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  31.53 
 
 		 118 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 130 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  28.57 
 
 		 132 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  26.53 
 
 		 122 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  32.47 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 123 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  24.19 
 
 		 133 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  24.17 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  32.5 
 
 		 127 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  29.51 
 
 		 139 aa  41.6  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  28.69 
 
 		 133 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  26.83 
 
 		 124 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>