More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_09101 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 		 334 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  82.28 
 
 		 335 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  73.81 
 
 		 336 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  65.49 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  50 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.12 
 
 		 416 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  47.01 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.16 
 
 		 652 aa  295  7e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.79 
 
 		 542 aa  295  8e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  42.73 
 
 		 536 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.25 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.25 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.23 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  43.18 
 
 		 323 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.52 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.35 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  51.69 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  46.53 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.51 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.87 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  42.44 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.18 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.35 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.24 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  38.82 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.82 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  38.82 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  38.82 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  38.82 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  38.82 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.82 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.66 
 
 		 245 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  38.33 
 
 		 320 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 373 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.4 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  37.84 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 372 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  38.82 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  38.4 
 
 		 247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.17 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.49 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 247 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.14 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.08 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  37.24 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  37.08 
 
 		 243 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  39.83 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  33.7 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.52 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.43 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  38.5 
 
 		 233 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  38.24 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  38.24 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.08 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  35.02 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  37.82 
 
 		 249 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.55 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  37.66 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  37.8 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.84 
 
 		 324 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.55 
 
 		 246 aa  165  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  36.63 
 
 		 314 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.82 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.6 
 
 		 246 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0655  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.91 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.229838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31740  rRNA methylase, putative, group 3  38.49 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.29916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.27 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  36.17 
 
 		 249 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  35.54 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  34.73 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8152  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.65 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.98 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  36.33 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.17 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03800  rRNA methylase, putative, group 3  35.86 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.395862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.49 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  37.11 
 
 		 247 aa  155  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  36.03 
 
 		 251 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.61 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.24 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  37.45 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.4 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.44 
 
 		 237 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.63 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  37.08 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  35.87 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0685  rRNA methyltranferase  45.36 
 
 		 246 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.06 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.29 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.29 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  37.76 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  29.41 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.87 
 
 		 246 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>