44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2622 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  100 
 
 		 481 aa  983    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  50.62 
 
 		 480 aa  529  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  51.46 
 
 		 482 aa  518  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  46.25 
 
 		 485 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0694  homospermidine synthase  48.23 
 
 		 486 aa  481  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  38.03 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  39.75 
 
 		 470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  37.55 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  38.05 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  36.13 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  36.19 
 
 		 472 aa  319  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  38.16 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1078  homospermidine synthase  38.2 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1154  Homospermidine synthase  38.83 
 
 		 476 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00185878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  39.09 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2138  homospermidine synthase  38.33 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2727  homospermidine synthase  36.98 
 
 		 481 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3423  homospermidine synthase  37.21 
 
 		 477 aa  291  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0933  Homospermidine synthase  37.63 
 
 		 476 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1345  homospermidine synthase  38.88 
 
 		 474 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  38.28 
 
 		 482 aa  289  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  37.63 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  37.79 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  37.58 
 
 		 476 aa  285  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  38.05 
 
 		 478 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4552  homospermidine synthase  37.76 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  37.63 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  37.45 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4834  homospermidine synthase  38.8 
 
 		 478 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  37.45 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3707  homospermidine synthase  35.05 
 
 		 480 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2688  homospermidine synthase  34.23 
 
 		 483 aa  273  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3300  Homospermidine synthase  34.36 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4263  homospermidine synthase  33.74 
 
 		 481 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3602  Homospermidine synthase  34.57 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  34.17 
 
 		 469 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  34.17 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  33.95 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  35.22 
 
 		 473 aa  262  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  33.54 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  33.75 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4066  hypothetical protein  39.78 
 
 		 171 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4254  homospermidine synthase-like protein  27.13 
 
 		 423 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4123  homospermidine synthase-like  27.76 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>