30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4123 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4254  homospermidine synthase-like protein  95.32 
 
 		 423 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4123  homospermidine synthase-like  100 
 
 		 423 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4066  hypothetical protein  55.17 
 
 		 171 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0454  hypothetical protein  24.88 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0390  hypothetical protein  24.81 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0330  group-specific protein  24.88 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0327  hypothetical protein  24.88 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.031116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0358  hypothetical protein  24.81 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.858837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0343  hypothetical protein  24.81 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0405  hypothetical protein  24.13 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0458  hypothetical protein  24.05 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4913  hypothetical protein  23.69 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0338  hypothetical protein  24.69 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  28.28 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  25.89 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  25.11 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  25.05 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  24.65 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  25.87 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  24.39 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  24.12 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  25.53 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  28.02 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  25 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  24.27 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  25.48 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  21.53 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  23.62 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  27.93 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  23.56 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>