45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4066 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4066  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4123  homospermidine synthase-like  55.17 
 
 		 423 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4254  homospermidine synthase-like protein  55.63 
 
 		 423 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  39.78 
 
 		 481 aa  54.3  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4263  homospermidine synthase  39.29 
 
 		 481 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  36.59 
 
 		 482 aa  47.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  36.78 
 
 		 481 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0454  hypothetical protein  29.57 
 
 		 421 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  36.78 
 
 		 476 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0458  hypothetical protein  29.57 
 
 		 421 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  38.54 
 
 		 473 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1078  homospermidine synthase  33.71 
 
 		 476 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0358  hypothetical protein  27.93 
 
 		 421 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.858837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0327  hypothetical protein  27.93 
 
 		 421 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.031116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0330  group-specific protein  27.93 
 
 		 421 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0343  hypothetical protein  27.93 
 
 		 421 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0390  hypothetical protein  27.93 
 
 		 421 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0405  hypothetical protein  29.57 
 
 		 421 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4913  hypothetical protein  29.57 
 
 		 421 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  35.63 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  35.63 
 
 		 478 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  35.63 
 
 		 482 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  35.63 
 
 		 482 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  39.02 
 
 		 472 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1154  Homospermidine synthase  34.52 
 
 		 476 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00185878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  35.71 
 
 		 470 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  36.14 
 
 		 469 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  31.4 
 
 		 471 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  36.14 
 
 		 469 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3300  Homospermidine synthase  35.37 
 
 		 483 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3423  homospermidine synthase  31.03 
 
 		 477 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  32.18 
 
 		 475 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  27.82 
 
 		 472 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3602  Homospermidine synthase  35.37 
 
 		 483 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  32.61 
 
 		 481 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2688  homospermidine synthase  32.71 
 
 		 483 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  27.82 
 
 		 472 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  33.7 
 
 		 476 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2138  homospermidine synthase  35.71 
 
 		 476 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  33.33 
 
 		 475 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3707  homospermidine synthase  35.37 
 
 		 480 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  33.7 
 
 		 476 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  33.71 
 
 		 486 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  32.18 
 
 		 478 aa  41.2  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0338  hypothetical protein  30.17 
 
 		 421 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>