34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4254 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4123  homospermidine synthase-like  94.56 
 
 
423 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4254  homospermidine synthase-like protein  100 
 
 
423 aa  807    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4066  hypothetical protein  54.36 
 
 
171 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0454  hypothetical protein  25.62 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0327  hypothetical protein  24.88 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.031116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0330  group-specific protein  24.88 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0390  hypothetical protein  24.81 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0343  hypothetical protein  24.81 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0358  hypothetical protein  24.81 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.858837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0458  hypothetical protein  24.26 
 
 
421 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0405  hypothetical protein  24.63 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4913  hypothetical protein  24.44 
 
 
421 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0338  hypothetical protein  24.56 
 
 
421 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  27.25 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  25.3 
 
 
486 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  26.05 
 
 
475 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  24.66 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  24.39 
 
 
482 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  28.53 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  26.06 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  25.07 
 
 
471 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  25.67 
 
 
469 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  25.67 
 
 
469 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  24.8 
 
 
482 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  23.05 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  23.05 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  25.76 
 
 
472 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  24.07 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  27.79 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  22.22 
 
 
480 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  23.94 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  24.04 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  20.9 
 
 
485 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  24.07 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>