42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0077 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  55 
 
 		 246 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  49.32 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  44.25 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  37.19 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  50.34 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  36.19 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  45.7 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  42.86 
 
 		 202 aa  141  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  35.65 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  34.31 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  46.71 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  41.06 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  41.06 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  40.4 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  41.06 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  44 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  41.71 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  32.93 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  34.57 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  28.81 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  35.81 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  34.34 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  35.41 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  38.41 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  45.53 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  36 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  26.5 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  32.59 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  28.47 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  32.28 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  33.73 
 
 		 109 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  29.1 
 
 		 257 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  37.23 
 
 		 112 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  29.73 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 		 113 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  35.63 
 
 		 113 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  31.33 
 
 		 150 aa  42  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  29.63 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>