More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0039 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  51.45 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  46.48 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  46.48 
 
 		 155 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  47.48 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  38.3 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  47.14 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 162 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  46.21 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  43.36 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  41.61 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  38.57 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  41.01 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  44.7 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  40.58 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  44.22 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  41.67 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  42.36 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  41.84 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  42.03 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  41.01 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  36.96 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  40.91 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.59 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  38.36 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  39.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2026  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  35.82 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  39.01 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.71 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>