More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2203 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  176  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  97.8 
 
 		 91 aa  173  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  96.7 
 
 		 91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  75.56 
 
 		 90 aa  135  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  74.73 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  73.63 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  74.44 
 
 		 90 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  65.56 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  65.56 
 
 		 92 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  66.67 
 
 		 90 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1701  HU-like DNA-binding protein alpha subunit  72.22 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  60 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  61.11 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  58.89 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  58.89 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03877  HU, DNA-binding transcriptional regulator, alpha subunit  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.380115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3994  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03830  hypothetical protein  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4234  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4025  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0158227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4543  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.440082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4448  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  hitchhiker  0.00101008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3218  DNA-binding protein HU alpha subunit  55.56 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.585838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5469  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4491  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0852675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  60 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  60 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3710  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4381  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.842423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0213  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00855152  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4577  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4414  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.18011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4503  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0164141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  60 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4501  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.358882  normal  0.0495174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0222  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3864  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0226  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0975648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0290  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0031706  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>