More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10147 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  100 
 
 
383 aa  781  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  38.6 
 
 
454 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  36.62 
 
 
451 aa  243  4e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  7.88125e-08 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  37.4 
 
 
442 aa  243  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  36.55 
 
 
454 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  37.89 
 
 
448 aa  233  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 
455 aa  223  5e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 
455 aa  223  5e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  35.52 
 
 
440 aa  222  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  35.2 
 
 
442 aa  217  3e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  32.65 
 
 
453 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 
438 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  32.75 
 
 
446 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  30.42 
 
 
441 aa  183  4e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  9.08978e-08 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  29.62 
 
 
437 aa  179  6e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  31.08 
 
 
437 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  30.92 
 
 
439 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  30.43 
 
 
467 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 
445 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  32.3 
 
 
445 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  30.58 
 
 
437 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  30.92 
 
 
436 aa  165  1e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  30.85 
 
 
447 aa  165  1e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  32.77 
 
 
439 aa  164  2e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  29.82 
 
 
433 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  32.21 
 
 
399 aa  163  4e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  30.34 
 
 
412 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  28.11 
 
 
426 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  26.48 
 
 
428 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  31.55 
 
 
397 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  26.48 
 
 
428 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  28.5 
 
 
426 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  30.08 
 
 
412 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  31.13 
 
 
441 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  31.12 
 
 
439 aa  156  5e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  28 
 
 
447 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  27.98 
 
 
426 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  28.35 
 
 
419 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  1.91252e-09 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  27.98 
 
 
408 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  33.16 
 
 
416 aa  153  6e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  30.93 
 
 
437 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.12 
 
 
439 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  31.76 
 
 
437 aa  147  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 
434 aa  147  4e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  29.55 
 
 
446 aa  147  4e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  26.39 
 
 
475 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.99 
 
 
448 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.26 
 
 
448 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  31.59 
 
 
360 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  30.17 
 
 
454 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  26.48 
 
 
434 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.44 
 
 
423 aa  143  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  27.66 
 
 
425 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  27.91 
 
 
435 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  26.98 
 
 
423 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  26.98 
 
 
423 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.98 
 
 
423 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  4.29728e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.98 
 
 
423 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.98 
 
 
423 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.98 
 
 
423 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  2.20398e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.98 
 
 
423 aa  142  1e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  26.98 
 
 
423 aa  141  2e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  29.24 
 
 
439 aa  141  2e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  28.29 
 
 
434 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  26.7 
 
 
428 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  29.9 
 
 
437 aa  140  4e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 
424 aa  140  5e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  29.84 
 
 
440 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  28.46 
 
 
418 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  29.84 
 
 
440 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.6 
 
 
423 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  3.15224e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  30.83 
 
 
446 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  29.56 
 
 
459 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  30.5 
 
 
420 aa  135  1e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2280  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.59 
 
 
392 aa  135  1e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.69897  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.2 
 
 
441 aa  135  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  28.72 
 
 
439 aa  134  2e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  29.84 
 
 
440 aa  133  4e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  29.2 
 
 
430 aa  134  4e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  28.39 
 
 
450 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  24.47 
 
 
430 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  28.61 
 
 
444 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00801  ABC transporter, membrane component  34.91 
 
 
405 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 
425 aa  132  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  26.63 
 
 
424 aa  131  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  28.32 
 
 
437 aa  131  2e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.93 
 
 
441 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.87 
 
 
423 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.87 
 
 
423 aa  130  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.85 
 
 
453 aa  130  4e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.87 
 
 
423 aa  130  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06713e-09 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  27.93 
 
 
444 aa  129  9e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  27.06 
 
 
441 aa  129  1e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  29.35 
 
 
445 aa  129  1e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49608  FeS assembly protein suf  32.05 
 
 
690 aa  128  2e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  30.17 
 
 
440 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.6 
 
 
423 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  3.49756e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.6 
 
 
423 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06248e-08 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  24.8 
 
 
422 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  31.19 
 
 
430 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>