112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3511 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  50.62 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  48.8 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  50 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  50.31 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  46.88 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  46.06 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  44.05 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  49.38 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  49.38 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  49.38 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  48.8 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  56.78 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  48.78 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  41.62 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  44.97 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  42.53 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  44.38 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  48.15 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  46.3 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  53.68 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  48.77 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  42.86 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  47.2 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  43.53 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  39.04 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  26.62 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  35.26 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  30.56 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  26.72 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  34.93 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  26.87 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  33.91 
 
 		 512 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  33.09 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  31.09 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  25.95 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  24.62 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  35.21 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  38.14 
 
 		 549 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  27.21 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  37.37 
 
 		 646 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  24.62 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 550 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  29.22 
 
 		 203 aa  51.2  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  24.62 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  24.81 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  24.62 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  26.38 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  24.62 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  24.62 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  26.97 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  36.78 
 
 		 555 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.4 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  27.21 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  33.03 
 
 		 555 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  26.47 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  24.32 
 
 		 474 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  26.47 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  36.9 
 
 		 634 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  27.21 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  27.21 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  22.31 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  32.19 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  27.21 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  26.76 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  26.76 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  27.21 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  27.21 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  25.74 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  22.33 
 
 		 486 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  40.28 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.03 
 
 		 470 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  22.33 
 
 		 474 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  34.58 
 
 		 561 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  36.14 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.5 
 
 		 480 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  29.47 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  32.14 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.15 
 
 		 471 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  30.95 
 
 		 579 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.33 
 
 		 486 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  36.56 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  23.75 
 
 		 114 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  33.78 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  32.47 
 
 		 521 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  20.17 
 
 		 479 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  32.89 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 498 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  37.35 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  26.52 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  30.07 
 
 		 575 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  30.4 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  35.16 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  32 
 
 		 486 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>